모빌 슈트 건담 디 오리진 20

우주세기 0079, 콜로니 사이드 3는 지온 공국을 자칭하며 지구 연방 정부에 독립전쟁을 선포했다. 그리고 콜로니 사이드 7 내부에서 발발한 지온군과 수비대의 전투에 휘말린 소년 아무로는, 아버지가 개발한 신형 MS ‘건담’에 탑승하여, 비범한 조종을 보인다.
아버지와의 이별, 소녀 라라아와의 만남을 거쳐 뉴타입으로 각성한 아무로는, 일곱 대의 돔과 전함 한 척을 격파한다. 그 후 지온군 극비 시설의 파괴 명령을 받고 동료들과 함께 텍사스 콜로니에 돌입, 뉴타입 전용 MA와 접촉하여 어렵게 이기지만, 숙적 샤아가 조종하는 신형 MS 겔구구에게 패해 건담은 대파되고 만다. 라라아가 전장에 나타난 탓에 건담의 숨통을 끊지 않고 이탈한 샤아는, 소년 시절을 보낸 곳에서 친동생 세일러와 재회하여 자신의 흉금을 토로한다.
뉴타입들은 인간이 가진 가능성을 넓히는 선구자가 될 수 있을까? 하지만 가혹한 현실은 그들에게 우수한 병기로서의 역할만을 요구한다.
모스크 한 박사에 의해 마그넷 코팅 처리를 받은 건담에 탑승한 아무로는, 슬레거가 조종하는 코어 부스터와 함께 샤아의 책동에 의해 고립된 지온의 거점 솔로몬으로 출격한다. 연방의 신병기 솔라 시스템의 겁화에 의해 불타는 우주요새를 무대로, 더 큰 비극의 막이 오르려 하고 있었다.